Audacity : logiciel d'enregistrement de son numérique et d'édition de sources audionumériques sous différents formats.
EduAnatomist : logiciel de visualisation de neuroimages basé sur le logiciel « Anatomist » lié à la banque d'images cérébrales Neuropéda (collection d'images IRM anatomiques et fonctionnelles).
GenieGen2 : logiciel permettant d'analyser des séquences d'ADN, ARN et de protéines (de JF Madre)
Hominines: logiciel permettant d'étudier l'histoire évolutive des Grands Primates grâce à une banque de données et des outils de mesure.
Mesurim Pro (de JF Madre): logiciel permettant de compter, mesurer, détourer, acquérir,...
Phylogène: logiciel permettant d'établir des relations de parenté entre les Vertébrés actuels et fossiles à partie de données morphologiques, anatomiques et moléculaires.
Rastop : logiciel de visualisation moléculaire.
Tectoglob : logiciel permettant de représenter des données géologiques à l'échelle du globe, d'étudier la tectonique des plaques et de modéliser les variations du niveau marin.
Tomographie V2 (de Ph Cosentino) : application permettant d'obtenir rapidement des coupes tomographiques sur le globe
